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该CRAM文件格式是类似的二进制对齐/地图(BAM)的文件格式,但设有更好的文件压缩和重组面向列的二进制容器格式。随着数据量的遗传软件领域增多,CRAM格式的设计,以减少对齐数据的磁盘足迹。短读对准是解密的过程,其中一个序列来自于基因组中。因为参考基因组是相当大的,你是不是一直在寻找的参考基因组精确匹配这是很困难的。短读对准被用来搜索匹配和近场比赛巨大的序列。由于序列是如此之大,由格式,如CRAM提供的压缩是必要的保存文件大小的管理。
通过EBI,欧洲分子生物学实验室的分站研制的压缩比对文件格式;存储短DNA序列读取从短读对准如BWA,BBMap和BLAT产生比对。
该CRAM文件格式是类似的二进制对齐/地图(BAM)的文件格式,但设有更好的文件压缩和重组面向列的二进制容器格式。随着数据量的遗传软件领域增多,CRAM格式的设计,以减少对齐数据的磁盘足迹。短读对准是解密的过程,其中一个序列来自于基因组中。因为参考基因组是相当大的,你是不是一直在寻找的参考基因组精确匹配这是很困难的。短读对准被用来搜索匹配和近场比赛巨大的序列。由于序列是如此之大,由格式,如CRAM提供的压缩是必要的保存文件大小的管理。