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一个Affymetrix基因芯片是包含一个芯片有效期为一个实验的生物芯片。为了创建这些芯片，玻璃或矽载玻片排列的探针，其中报告的表达水平（强度）为完全匹配（PM）和错配（MM）的值的基础上，无论它们是与原始DNA样品互补的。这些值可以用于研究DNA改变，称为单核苷酸多态性（SNP），其在人类和动物疾病research.The CEL文件格式中使用的有多个版本，其使用不同的格式。例如，第3版用途ASCII文本格式而第4版使用二进制format.NOTE：CEL文件需要相应.CDF文件，该文件是字典存储在CEL文件的原始探针水平数据。 MATLAB有内置函数调用affyread可以使用在Windows版本的软件来读取CEL文件。